V souladu se zákonem o finanční kontrole zajišťuje odbor komplexní kontrolu nakládání s veřejnými prostředky u příspěvkových organizací zřízených statutárním městem Liberec. Dále provádí kontroly u žadatelů o veřejnou finanční podporu nebo u příjemců veřejné finanční podpory. Tyto veřejnosprávní kontroly v oblasti samostatné působnosti obce jsou vykonávány na základě ročního plánu kontrol schváleného Radou města Liberec. Interním auditem, který je nedílnou součástí kontrolní činnosti, jsou posuzovány a hodnoceny činnosti a postupy uvnitř Magistrátu města Liberec.

• Zajišťuje kontrolní činnost v souladu s příslušnými právními a interními předpisy všech subjektů, jejichž zřizovatelem je statutární město Liberec.
• Zajišťuje kontrolní činnost v souladu s právními u všech subjektů, jenž jsou žadateli či příjemci dotací z rozpočtu statutárního města Liberec.
• Prošetřuje postoupené stížnosti, petice a podněty.
• Vykonává metodickou pomoc v souladu se zákonem o finanční kontrole ve veřejné správě.
• Na základě požadavku tajemníka magistrátu a výsledku vnitřního auditu navrhuje opatření ke zefektivnění chodu úřadu.
• Zajišťuje realizaci interních auditů dle zákona č. 320/2001 Sb., o finanční kontrole ve veřejné správě.
• Dále zajišťuje technikou podporu činnosti Kontrolního výboru Zastupitelstva města Liberec.